Caractérisation des tumeurs neuroendocrines pulmonaires

Caractérisation des tumeurs neuroendocrines pulmonaires

Projet 1 : Caractérisation transcriptomique spatiale des tumeurs neuroendocrines pulmonaires rares

Résumé du projet :

Ce projet vise à caractériser finement, par la technologie innovante de transcriptomique spatiale (Xenium – 10X Genomics), les tumeurs neuroendocrines pulmonaires rares, en particulier les carcinomes pulmonaire neuroendocrines mixtes à petites (CPC) et grandes cellules (CNEGC).

Contexte et enjeux :

Les carcinomes mixtes CPC-CNEGC représentent des formes rares (<1% des cancers pulmonaires) caractérisées par une forte hétérogénéité morphologique et moléculaire. Le pronostic très sombre de ces tumeurs (<1 an de survie médiane) nécessite une meilleure compréhension moléculaire et spatiale afin d’optimiser leur diagnostic, pronostic et orientation thérapeutique.

Objectifs du projet :

  • Décrire l’hétérogénéité spatiale moléculaire des carcinomes mixtes CPC-CNEGC.
  • Identifier les profils transcriptomiques et les biomarqueurs clés de ces tumeurs rares.
  • Déterminer la similarité et les différences moléculaires entre les composantes CPC et CNEGC dans ces tumeurs mixtes.

Méthodologie :

  • Réalisation de transcriptomique spatiale (Xenium, 10X Genomics) pour caractériser l’expression génique in situ au niveau cellulaire.
  • Analyse bioinformatique approfondie pour déterminer les marqueurs d’intérêt et les voies moléculaires spécifiques aux différents phénotypes.

Résultats attendus :

  • Cartographie précise de l’expression génique des carcinomes mixtes CPC-CNEGC.
  • Identification de marqueurs spécifiques utiles pour améliorer le diagnostic.
  • Meilleure compréhension des processus de transition moléculaire entre les différents types de tumeurs neuroendocrines.

Institutions impliquées et WP IHU :

  • IPMC (Institut de Pharmacologie Moléculaire et Cellulaire) – WP1
  • CHU de Nice (LPCE – Laboratoire de Pathologie Clinique et Expérimentale) – WP3
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Projet 2 : Prévalence et valeur pronostique du biomarqueur DLL3 dans le carcinome pulmonaire à petites cellules

Résumé du projet :

Ce projet a pour but de déterminer précisément la prévalence et la valeur pronostique du biomarqueur DLL3 dans les carcinomes pulmonaires à petites cellules (CPC), ainsi que d’évaluer sa corrélation avec les différents sous-types moléculaires du SCLC, afin d’optimiser les stratégies thérapeutiques ciblées.

Contexte et enjeux :

Le carcinome pulmonaire à petites cellules (CPC) demeure une maladie agressive avec peu d’options thérapeutiques efficaces en cas de rechute. DLL3, un biomarqueur émergeant lié à la voie Notch, pourrait constituer une cible prometteuse. Cependant, sa prévalence exacte et sa valeur pronostique en contexte clinique réel restent mal définies.

Objectifs du projet :

  • Évaluer la prévalence précise de l’expression du DLL3 à différents seuils d’expression tumorale et d’intensités de marquage par immunohistochimie.
  • Analyser la valeur pronostique du DLL3 sur la survie globale réelle des patients atteints de SCLC.
  • Corréler l’expression du DLL3 avec les sous-types moléculaires du CPC (ASCL1, NEUROD1, POU2F3, YAP1).

Méthodologie :

  • Analyse rétrospective d’échantillons tumoraux de patients diagnostiqués entre 2017 et 2022.
  • Immunohistochimie automatisée standardisée.
  • Corrélation clinique et moléculaire avec les sous-types du CPC, traitement reçu et survie réelle des patients (real-world data).

Résultats attendus :

  • Définition précise des seuils cliniquement pertinents de DLL3 pour l’indication thérapeutique.
  • Validation de DLL3 comme marqueur pronostique fiable.
  • Contribution directe à l’orientation des traitements innovants ciblant DLL3 (anticorps bispécifiques, immunothérapie).

Institutions impliquées et WP IHU :

  • CHU de Nice (LPCE – Laboratoire de Pathologie Clinique et Expérimentale, Biobanque Côte d’Azur) – WP1
  • Collaboration avec Amgen USA.
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